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相良のアイラトビカズラ

(あいらのあいらとびかずら)

熊本県山鹿市 名木・巨木

青島亜熱帯性植物群落

(あおしまあねったいせいしょくぶつぐんらく)

宮崎県宮崎市 未分類（自然）

阿寒湖のマリモ

(あかんこのまりも)

北海道釧路市 未分類（自然）

秋吉台

(あきよしだい)

山口県美祢市 未分類(観光地・名勝)

秋芳洞

(あきよしどう)

山口県美祢市 鍾乳洞・洞窟

浅間山熔岩樹型

(あさまやまようがんじゅけい)

群馬県吾妻郡嬬恋村 未分類（自然）

石徹白の大スギ

(いとしろのおおすぎ)

岐阜県郡上市 名木・巨木

国の特別天然記念物

岩間の噴泉塔群

(いわまのふんせんとうぐん)

石川県白山市 未分類（自然）

魚津埋没林

(うおづまいぼつりん)

富山県魚津市 未分類（自然）

牛島のフジ

(うしじまのふじ)

埼玉県春日部市 未分類(観光地・名勝)

大島のサクラ株

(おおしまのさくらかぶ)

東京都大島町 名木・巨木

国の特別天然記念物

尾瀬ヶ原

(おぜがはら)

群馬県利根郡片品村 湖沼・池・湿原

鹿児島県のソテツ自生地

(かごしまけんのそてつじせいち)

鹿児島県 未分類（自然）

春日山原始林

(かすがやまげんしりん)

奈良県奈良市 未分類（自然）

上高地

(かみこうち)

長野県松本市 高原

蒲生の大クス

(かもうのおおくす)

鹿児島県姶良市 名木・巨木

国の特別天然記念物

加茂の大クス

(かものおおくす)

徳島県三好郡東みよし町 名木・巨木

国の特別天然記念物

狩宿の下馬ザクラ

(かりやどのげばざくら)

静岡県富士宮市 名木・巨木

黒部峡谷

(くろべきょうこく)

富山県黒部市 滝・渓谷・河川

コウシンソウ自生地

(こうしんそうじせいち)

栃木県日光市 未分類（自然）

昭和新山

(しょうわしんざん)

北海道有珠郡壮瞥町 山岳

白馬連山高山植物帯

(しろうまれんざんこうざんしょくぶつたい)

長野県北安曇郡白馬村 未分類（自然）

杉の大スギ

(すぎのおおすぎ)

高知県長岡郡大豊町 名木・巨木

国の特別天然記念物

大雪山旭岳

(たいせつさんあさひだけ)

北海道上川郡東川町 山岳

田島ヶ原サクラソウ自生地

(たじまがはらさくらそうじせいち)

埼玉県さいたま市桜区 未分類（自然）

大根島の熔岩隧道

(だいこんじまのようがんずいどう)

島根県松江市 未分類（自然）

都井岬ソテツ自生地

(といみさきそてつじせいち)

宮崎県串間市 未分類（自然）

鳴沢熔岩樹型

(なるさわようがんじゅけい)

山梨県南都留郡鳴沢村 未分類（自然）

日光杉並木

(にっこうすぎなみき)

栃木県日光市 未分類(観光地・名勝)

根尾谷断層

(ねおだにだんそう)

岐阜県本巣市 未分類（自然）

根尾谷の菊花石

(ねおだにのきっかせき)

岐阜県本巣市 未分類（自然）

根反の大珪化木

(ねそりのだいけいかぼく)

岩手県二戸郡一戸町 未分類（自然）

野幌原始林

(のっぽろげんしりん)

北海道北広島市 未分類（自然）

羽黒山の杉並木

(はぐろさんのすぎなみき)

山形県鶴岡市 未分類(観光地・名勝)

東根の大ケヤキ

(ひがしねのおおけやき)

山形県東根市 名木・巨木

国の特別天然記念物

宝生院のシンパク

(ほうじょういんのしんぱく)

香川県小豆郡土庄町 名木・巨木

国の特別天然記念物

御岳の鏡岩

(みたけのかがみいわ)

埼玉県児玉郡神川町 未分類（自然）

八釜の甌穴群

(やかまのおうけつぐん)

愛媛県上浮穴郡久万高原町 未分類（自然）

屋久島スギ原始林

(やくしますぎげんしりん)

鹿児島県熊毛郡屋久島町 未分類（自然）

焼走り熔岩流

(やけはしりようがんりゅう)

岩手県八幡平市 山岳

湧玉池

(わくたまのいけ)

静岡県富士宮市 湖沼・池・湿原